一、接種前雞帶強毒。接種時雞群內已潛伏了強毒病原微生物，只是未表現明顯的臨床癥狀，或接種人員和接種用具帶有強毒微生物。

二、疫苗使用技術錯誤。例如，有的養雞戶利用飲水接種疫苗，因使用的自來水帶有消毒藥，或者使用金屬類飲水器，或者停水時間不當，或者疫苗飲水時間過長（超過兩小時以上）等，造成疫苗效價降低，從而影響了免疫效果。

三、接種時間不適宜。農戶難以確定接種疫苗的準確時間，免疫效果也就存在不確切的可能性。如果接種時間過早，則會與雛雞體內的母源抗體發生中和反應，被中和的疫苗就起不到免疫作用；若疫苗接種時間過晚，因雛雞體內母源抗體低，則可能在預防接種前已被病毒感染而發病。

四、接種后引起不良反應。例如雞新城疫Ⅰ系疫苗、雞傳染性支氣管炎疫苗的接種，可能造成本來不明顯的敗血支原體病暴發。因此，當雞群有敗血支原體潛伏又要進行上述疫苗接種時，應考慮提前給免疫接種的雞服用藥物，以便減輕或防止潛伏疾病暴發。

五、疫苗使用劑量過大。例如，雛雞大劑量使用新城疫Ⅰ系疫苗會導致扭頭、轉圈等神經癥狀。大劑量使用傳染性喉氣管炎疫苗會出現流淚、喉頭出血等傳染性喉氣管炎癥狀。

六、不同種類疫苗間的相互干擾。養雞場往往幾種疫苗同時使用。例如，有的養雞戶同時接種雞新城疫Ⅰ系疫苗和雞痘疫苗，由于雞新城疫Ⅰ系苗具有很強的干擾作用，可導致雞痘疫苗免疫失敗，從而有可能發生雞痘。因此，為了保證免疫效果，最好單獨接種疫苗，以便產生堅強的免疫力。