很多中獸藥散劑已經在臨床上應用，但是大多只能用于預防動物疾病，真正能夠用于治療的中獸藥很少，除非在中獸藥里面加了西藥。應用效果不理想的原因有三：

一是中獸藥的制劑原因，部分開發出來的注射劑，如青開靈，魚腥草注射液等，應用效果就很好，因此，中草藥散劑應用效果差，主要是因為中獸藥的有效成分不能充分發揮作用，或者說成是有效成分不能充分吸收，或者說是有效成分不足。

二是中獸藥臨床配伍不合理，這種情況有很多，很多養殖戶用的中獸藥處方，都不是根據自身養殖場或個例來開出來的處方，而是那些商品化的大眾處方，這些處方當然不是萬能，不是什么情況下都能應用的。中藥很講究事物的兩面性，如果藥物用反了，只會適得其返。

三是用藥時期及至耐藥性的問題，很多養殖戶喜歡無論什么時候都加點中草藥，認為中獸藥是萬能的，但是大家都知道，細菌的生存能力是很強的，難道就沒有細菌能夠適應中獸藥能生存的可能性性，這是一個值得研究的問題，比如，現在就有很多人提出，抗生素，中獸藥等可以和益生菌共用的問題，說明了細菌是可以和中草藥共生的。這種共生作用有可能就是未來細菌對中草藥抗藥性研究的一個方向。

因此，目前我們要考慮的有中獸藥是否真的不產生耐藥性，還是中獸藥的耐藥性沒有被我們發現。另一個就是中獸藥的吸收問題和劑量問題，這是決定中獸藥是否有效的一個關鍵因素。第三就是中獸藥的配伍問題及臨床應用問題。