鴨瘟尚無有效藥物可治療，而對鴨霍亂用藥物治療效果卻很好！此兩種病的癥狀很相似，很易混淆，故在防治時務必準確鑒別，方能減少不應有的損失。

１、鴨霍亂一般是零星發生，突然死亡，尤其是正在產蛋的母鴨頗為多見。鴨霍亂能傳染給雞、 甚至豬；而鴨瘟流行范圍較廣，病程也較長，一般多在發病后４－－６天死亡，但不傳染給雞、 與豬。

２、翻開鴨肛門，出現充血，水腫或有黃綠色假膜者，則可判斷是鴨瘟。

３、患鴨霍亂病的病鴨，死亡前常搖頭，死亡時口、鼻流稀血水，嗉囊里充滿飼料，手摸感覺硬實；而患鴨瘟的病鴨，流涕流淚，死亡時眼睛充血，嗉囊空虛無食物，手摸時感到松軟。

４、鴨霍亂可用磺胺類藥物或抗菌素治療，效果滿意，但對鴨瘟則無效。

５、發生鴨霍亂的病鴨或死鴨，肝臟表面有許多針頭大小、分布均勻的灰白色的壞死；而鴨瘟則沒有這些癥狀，但全身皮膚表面有許多出血斑點，頭頸部出血更為嚴重。