自上世紀40年代人們發現磺胺類藥物可用于防治球蟲病之后，陸續發現呋喃類、生物堿類、離子載體類等藥物都能用來防治球蟲病，已報道的抗球蟲藥達50多種，其中一些藥物由于毒性太大或療效不佳而被淘汰。近年來仍在生產中應用的抗球蟲藥有20余種，目前常用的有下列幾種。

一、聚醚類藥物此類藥物其分子結構具有一個有機酸基團和多個醚基團，在溶液中帶負電荷，作用機理是與鈉、鉀、鈣、鎂等在蟲體內起重要作用的陽離子結合成脂溶性絡合物，協助陽離子進入蟲體內，破壞細胞內外的正常離子平衡，使細胞內外形成滲透壓差，大量水分進入，最后導致蟲體細胞破裂死亡。這類藥物還可通過干擾營養物質穿過細胞膜的運輸而發揮作用。細菌學試驗表明，當膜外的PH值低于膜內時，糖類的運輸就受到抑制。同樣由于宿主細胞膜被寄生蟲損壞后不能在細胞和腸管之間形成有效的屏障，而產生一個低PH值環境，使寄生蟲對糖類的吸收受到限制，從而達到抑制蟲體生長發育的目的。自1971年美國批準莫能菌素作為抗球蟲劑以來，先后開發應用了莫能菌素、鹽霉素、拉沙里霉素、馬杜拉霉素、海南霉素等。由于聚醚類抗生素具有很廣的抗球蟲譜，對雞的6種球蟲都有活性，沒有嚴重的耐藥性問題，一直被廣泛應用。但此類藥物之間有交叉耐藥性、有累加作用而無協同作用，與化學合成抗球蟲藥物無交叉耐藥性。

二、地克珠利屬苯腈類最新型廣譜抗球蟲藥，對各種球蟲具有極佳的殺滅作用。據試驗表明，地克珠利用量少、療效好、抗蟲譜廣、毒性極低、安全性高、性能穩定，在飼料加工、制粒等過程中藥效均不受影響，可以長期添加于飼料中，在動物屠宰前也無需停藥，不會抑制畜禽的生長發育，對柔嫩艾美球蟲、堆型艾美球蟲、毒害艾美球蟲、布氏艾美球蟲和變位艾美球蟲的抗球蟲指數分別達200、200、197、193、183，是一種高效、低毒、廣譜、便于應用的抗球蟲藥。

三、磺胺類藥用于抗球蟲作用的磺胺類藥有磺胺喹噁啉、磺胺氯吡嗪鈉、磺胺二甲基嘧啶、磺胺間甲氧嘧啶、磺胺間二甲氧嘧啶等，這類藥物的主要作用是抑制球蟲的生長和繁殖，并無直接殺蟲作用。其作用機理是與對氨苯甲酸競爭二氫葉酸合成酶，妨礙二氫葉酸合成，最終影響核蛋白的合成，抑制球蟲的生長與繁殖。此類藥主要影響球蟲第二代無性繁殖，對第一代裂殖體也有抑制作用，但這類藥物已使用多年，不少球蟲已對其產生耐藥性或交叉耐藥性，因此應與其它抗球蟲藥如氨丙啉或抗菌增效劑并用。治療時，必須使用足夠的劑量連續用藥，才能見效。否則球蟲容易產生耐藥性，并將這種耐藥性遺傳幾代。

四、尼卡巴嗪主要作用于第二代裂殖體，對球蟲生活史的其它階段無效。對球蟲的活性峰期在感染后第4天，感染后48小時用藥能完全抑制球蟲發育；若在72小時給藥，則效果降低。該藥對柔嫩、毒性、堆型、布氏和巨型艾美耳球蟲均有預防作用，具有高效、廣譜、不易產生耐藥性，不影響雞對球蟲產生免疫力的特點，且對雞有促進生長作用，并常被用在輪換用藥、穿梭用藥或聯合用藥中。

五、氨丙啉常用的是鹽酸氨丙啉，具有高效、安全不易產生耐藥性等特點，在生活史周期第3天出現高峰作用，主要作用于第一代裂殖體，阻止其形成裂殖子，對有性繁殖和子孢子也有一定程度的抑制作用，故在感染后第3天用藥對球蟲的抑制作用最強，作用機理是干擾球蟲的VBl的代謝，所以在給藥期間每千克飼料中VBl含量不應超過l00毫克，以免影響藥效。該藥在治療濃度下也不能全部抑制球蟲卵囊，所以用該藥治療的雞對球蟲仍能產生一定程度的免疫力。但由于它對小腸球蟲作用較弱，故常與其它抗球蟲藥聯合使用。

六、硝基苯酰胺類該類藥主要作用于球蟲第一代無性繁殖期的裂殖體，故在感染的第3天作用最強，主要有二硝基苯酰胺(球痢靈)和硝基氯苯酰胺等，由于作用譜不廣，使用有限，主要用于蛋雞和種母雞，但與洛克沙胂混合使用，能增強其藥效。

七、喹啉類本類藥物均難溶于水，內服吸收少，毒性小，其抗蟲作用與粉末顆粒大小有關，顆粒越細作用愈好。它的抗球蟲作用機理是破壞球蟲線粒體內細胞色素體系的電子運輸。一般制成的顆粒殘留量極低，在肝中濃度較高，對雞的各種球蟲均有效，但是，喹啉類是目前抗球蟲藥中產生耐藥性速度最快的一種，現已少用。

八、克球粉在我國使用很廣，對7種艾美耳球蟲均有效，主要作用于子孢子，其抑制作用超過殺滅作用，抑制球蟲活性高峰期是在感染后第1天，故用于治療時無價值，本品能抑制免疫力的產生，停藥過早往往導致球蟲病的爆發，同時球蟲對此藥易產生耐藥性，產生耐藥性的速度僅次于喹啉類，連用2～3年后，其抗球蟲指數明顯下降，目前用的較少。