加強鴨群的消毒，各個鴨舍之間，尤其是不同日齡的鴨群之間尤其要注意，每星期常規消毒 2 次以上，可以用消毒水飲水消毒，也可以用消毒水噴霧帶鴨消毒，可以在很大程度上防止細菌、病毒或者真菌等的大量繁殖，防止呼吸道等各種疾病的發生。

每月或每 2 個月進行徹底消毒一次，清理運動場上的糞便，將鴨舍內潮濕的墊料清理出來干燥用清潔的墊草代替。

常用的消毒劑有季銨鹽類、碘制劑、氯制劑、醛類、酚類、醇類、酸類、堿類、離子類等等，要根據消毒劑的種類和特點，在使用過程中進行準確的選擇。

不能盲目使用，隨意的增加使用濃度和混合使用。為了防止某一種消毒劑產生抗性，都建議每個鴨場準備 2-3 種不同類型的消毒劑，交替使用，效果好！