1 ．種蛋的挑選
選擇好的種蛋，不僅孵化率高，而且對雛鴨的質量和以后生長也有很大影響。因而在生產實踐中，要對番鴨種蛋進行嚴格的選擇，千萬馬虎不得。
（ l ）應選擇生產性能高而穩定、繁殖力強、健康母番鴨所產的蛋。凡是患有白痢、慢性呼吸道疾病等傳染性疾病的母鴨所產的蛋不能留做種蛋。
（ 2 ）蛋的大小應適中，符合品種要求。蛋重過重或過輕均不可用作種蛋。蛋形應正常，過圓或過長的蛋應剔除，否則影響孵化。蛋殼要完整，無裂縫；殼不能過薄、過厚，過薄、過厚均不利于孵化。
（ 3 ）種蛋應新鮮，蛋殼表面清潔，不能粘有糞便等污物。否則污染物中的病菌會侵入蛋內。
2 . 種蛋的保存
種蛋收集后要及時入孵。但在生產中不可能做到隨收隨孵，收集到一定數量后才能成批入孵，總有一個保存過程。種蛋即使經過嚴格挑選，品質優良，如果保存條件差，保存方法又不好，仍會對種蛋的孵化產生不良的影響。因此，應為種蛋保存創造一個良好的條件。
（ 1 ）保存時間：種蛋保存時間越短越好。保存時間短，孵化率高。保存時間7 天以內的，一般均能出雛。保存超過7 天，會使胚胎早期死亡增加，胚胎發育遲緩，孵化率降低，并且孵化出的雛鴨體質也差，成為弱雛，甚至成畸形雛。隨著種蛋保存時間的延長，孵化率也不斷降低。為保證種蛋有良好的質量，保存時間不宜過長，早春所產的蛋保存時間最長也不得超過14 天；夏秋季產的蛋應在7 天以內入孵。
( 2 ）溫度：保存種蛋的溫度以13 ～ 15 ℃ 為宜。保存時間7 天以內的，控制在15℃ ；如保持時間長的，溫度可低些。但也不能過低，如低于10℃ ，就會影響孵化率，甚至因受凍而失去孵化能力；如溫度高于胚胎發育的臨界溫度（23.9℃ ) ，胚胎會在保期間開始發育而不能出雛。
( 3 ）濕度：保存種蛋的相對濕度一般以70％ ～ 80％為宜。相對濕度過低，種蛋內的水分易蒸發，影響出雛率；如相對濕過高，有利于致病微生物的繁殖并侵入蛋內，使種蛋變質，導胚胎死亡。
( 4 ）保存環境：種蛋應貯存在專用貯存室內。先將種蛋碼放在蛋盤里，然后放在蛋盤架上，層層放置。放蛋時最好蛋的小頭向上、鈍端朝下放置。貯存室應清潔，通風良好，空氣新鮮，但又不能讓冷風直吹，冬暖夏涼。貯存室內不能有蚊蠅、老鼠，也不能有異味。不能與農藥、化肥等混放在一起。保存期間，在初期可不翻蛋。隨保存時間延長，應每天翻蛋，以防止蛋黃與蛋殼膜粘連。
3 ．種蛋消毒
種蛋表面有許多細菌，如種蛋粘有鴨糞或其他污物，細菌更多，而且細菌的繁殖速度很快，如不及時消毒，沾污在種蛋上的細菌會侵入胚胎內。因此，種蛋在保存前和入孵前各進行一次消毒，以殺滅種蛋表面上的病菌。消毒方法很多，下面介紹常用的幾種。
( 1 ）熏蒸法：這是當前使用比較普遍的一種消毒方法，既方便，消毒效果又好。用藥量為每立方米空間用30 毫升甲醛、15 克高錳酸鉀一起放在裝有種蛋的容器里如瓷盤或碗，隨即關閉門窗，室內溫度保持在25 ～ 27℃ ，濕度75％ ～ 80 ％。熏蒸20 ～ 30分鐘后打開門窗，以盡快排出藥氣，取出種蛋。消毒時應注意，甲醛和高錳酸鉀作用后產生的氣體，對人有刺激性，使用時應加以防護，避免接觸到皮膚或吸入。
( 2 ）新潔爾滅消毒法：用5 ％新潔爾滅，加水配成0.1％溶液，對種蛋噴霧消毒。也可將種蛋放入40 ～ 50 ℃ 的0 . 1 ％新潔爾滅溶液，浸泡3～5 分鐘后取出種蛋，待種蛋晾干后送貯蛋室或入孵。該方法使用也方便，但應注意，不可將肥皂、高錳酸鉀、升汞、碘、堿等物質摻入，以免藥液失效。
( 3 ）高錳酸鉀消毒法：將高錳酸鉀配制成0 . 02 ％溶液（即在50公斤水中加入10 克高錳酸鉀），然后把種蛋浸泡在40℃ 溶液中2 分鐘左右，取出濾干即可入孵。
( 4 ）紫外線消毒法：在離蛋面1 米左右處安裝一40 瓦的紫外線燈管，照射10 ～ 15 分鐘即可。
此外，還有抗生素溶液消毒法、氯消毒法、洗滌消毒法等，用得較多的是前面3 種方法。飼養者可根據具體情況選用。在消毒過程中，應注意的是，種蛋從消毒室內取出放入貯蛋室，如兩個地方溫差較大，種蛋應逐步降溫。否則因溫差較大，蛋殼表面會凝集濕氣，使蛋殼表面外膜的保護作用受到破壞，細菌容易入侵。
4 .種蛋運輸
沒有種番鴨飼養的飼養場，或還沒有飼養番鴨而準備飼養番鴨的飼養者，除引進苗鴨外，也可外購種蛋自行孵化飼養，這就涉及到種蛋運輸問題。種蛋的運輸方法可參考“綠頭野鴨”部分的有關內容。這里需要強調的是掌握好溫度，盡量避免過熱或過冷。溫度過高，要采取降溫措施，反之要保溫。同時在運輸途中避免種蛋被陽光暴曬或被雨淋。避免強烈震動，裝卸時要輕拿輕放，以免種蛋被碰破。種蛋運到目的地后，立即開箱檢查，發現有破損蛋，應剔除。如有污染物，應揩凈。然后應盡快入孵，不宜再保存。如購買嘌蛋的，運輸方法和注意點與此相同。運輸嘌蛋胚齡的大小，應根據路途遠近而定，以出雛前一天到達目的地為宜。
