成功的治療雞的呼吸道疾病要以迅速的臨床診斷，準確的病原分離和藥敏實驗的結果為依據，正確的選擇抗菌和抗病毒藥物，需要考慮的因素：藥物對病原的殺滅效果，機體的病理損傷和感染程度，藥物的藥效與藥動學，潛在的毒性與殘留，合并用藥可能產生的相互作用。
1、藥物治療的原則：呼吸系統疾病的特征是炎性損傷所致的分泌與滲出增多，損傷原因包括化學刺激，過敏性反應，細菌病毒感染，此時，機體對其排除能力降低，導致一系列的病理變化。治療的目的是減少滲出物的體積和黏度，使之有利于排除，從而避免對機體的不可逆性損傷。
2、正確的給藥途徑與劑量：合理確定用藥時間和用藥次數，使其療效長短結合，作用急緩結合，促進吸收和抑制滲出。針對CRD病程綿長的特點，投藥時間長，所選擇的藥物毒性低，應能夠以活性形式經腸道排除，減少對機體的副作用。
3、合治療的藥物：
四環素類：強力霉素、土霉素對支原體與大腸桿菌有效。
喹諾酮類：對大腸桿菌與支原體有效。
大環內酯類：紅霉素、泰樂菌素、北里霉素、林可霉素，這類藥物主要對支原體有特效，其中泰樂菌素能夠阻止大腸桿菌對呼吸道的黏附作用。
