鴨瘟及鴨霍亂是危害養鴨生產的兩大傳染病。鴨瘟是濾過性病毒，鴨霍亂是由禽巴氏桿菌引起，此兩種病均有體溫升高、精神萎靡、羽毛蓬松等相似病癥。鴨瘟目前尚無特效藥物治療，而鴨霍亂用藥物治療效果很好。

臨床上鑒別這兩種病的關鍵：一是看病勢。鴨瘟一般流行面廣，病情來得緩，死得較慢，而鴨霍亂是零星散發，來得急，死得快；二看傳染情況。鴨瘟不傳染雞、鵝、豬，而鴨霍亂傳染雞、鵝、豬；三看頭頸。鴨瘟頭腫，但常常搖頭（又稱搖頭瘟）。四看腳部。鴨瘟軟腳，故農村又稱鴨瘟叫軟腳瘟，而鴨霍亂只是關節發炎，腫脹，跛行；五看嗉囊。鴨瘟虛而無物，手摸時感覺松軟，而鴨霍亂嗉囊充滿食物，手摸感覺硬實；六看肛門。鴨瘟病鴨肛門充血、出血、水腫，嚴重時，粘膜外露。而鴨霍亂沒有這些病狀；七看糞便。鴨瘟病鴨拉白灰色或銅綠色糞便，而鴨霍亂拉紅色或淡紅色或棕色惡臭糞便，常污染泄殖腔外羽毛。

倘若鴨患的是霍亂，可立即采取藥物治療，效果較好的藥物有：①磺胺噻唑、磺胺二甲基嘧啶、長效磺胺每只鴨口服０．．２—０·３克，每天１次，連服３天或按０·５％—１％比例拌飼料喂３—５天。②青霉素每只成年鴨肌肉注射３—５萬單位，隔４小時注射１次，連用３次。③土霉素在飼料中添加０·０５％—０·１％也有效果或每只雛鴨每天服０·１５—０·３克，連服２—３天，或每公斤體重肌肉注射土霉素２５毫克，每天２次，連續２天或按每公斤體重口服４０毫克，每天１次，連用３—４天。④鏈霉素每只鴨肌注１０萬單位，每天１次。

在對病鴨進行治療的同時，還可采用禽霍亂蜂膠滅活菌苗緊急預防接種，接種３天后對控制疫情有顯著效果。 因鴨瘟病只能防，難治好，所以，如鑒別確診為鴨瘟病，唯一的方法就是注射鴨瘟疫苗。此疫苗能較快地使鴨體產生免疫力，不但在受鴨瘟威脅的鴨群中，就是在發病的鴨群中也可進行緊急預防接種。

但應注意：凡有臨床癥狀，體溫升高至４２·５℃以上者不應注射。疫苗的用法和用量，按瓶簽注明的劑量，用生理鹽水稀釋２００倍，在鴨胸肌注射１毫升，對初生鴨則將疫苗稀釋５０倍，在腿部肌肉注射０·２５毫升。本苗接種后３—４天可產生免疫力。２月齡以上的鴨免疫期為９個月。初生鴨免疫期為一個月，故初生鴨在３個月后應再進行一次免疫，對發育不良的鴨不宜使用。對純種鴨要先進行少量試種，觀察無反應后再擴大使用。