1、由于雞堆型球蟲發病的嚴重程度與攝入的卵囊數量有很大的關系，出欄后如何減少環境中的卵囊數量就是一個值的大家關注的問題。而球蟲的卵囊對絕大多數消毒劑耐受，反倒是清洗的干凈程度與進雞后早期的發病比例有一定的關系。因此，地面飼養的用戶需將地面和墻面用水泥、或者是用三合土抹平，利于沖洗。沖洗干凈后用20%的生石灰乳液進行地面處理，如有條件可用火焰噴燈進行燒灼，對殺死舍內球蟲卵囊有很好的效果。

網上飼養的，支撐物多使用鋼結以便于沖洗,如果是竹排等木制結構要方便拆卸，出雞后可以將網架拿到舍外浸泡沖洗，以防止小雞啄食到殘留在網架上被卵囊污染的糞便，造成早期的感染。

墊料及糞便要定期清理、定點堆放發酵以殺滅蟲卵。

2、合理的用藥預防程序對肉雞的整個生產過程很關鍵。臨床上的預防時間一般為上批雞首次出現球蟲癥狀的日齡再往前推三天。因為一個球蟲卵囊的生活史一般為7天，臨床中除急性感染外，一般在感染第三天表現出臨床癥狀。早期的預防多采用作用于無性繁殖時第一、二代裂殖體的藥物。如喹啉類的癸氧喹酯；常山酮；聚醚類的莫能菌素、鹽霉素、馬杜拉霉素等。第一次預防性投藥完成后，在間隔不低于7天的時間內進行第二次預防性投藥，這個療程用藥不要低于5天的用藥時間，而且藥的成分與第一次使用的藥品也要有區分。如果有條件，臨床上這兩次預防性投藥的最好的途徑是拌料使用。

在應用預防藥物的時候有兩個地方需要注意：

一、注意應用的時間，按常規量添加不要低于7天。這一點很重要，臨床上堆型球蟲的爆發與用藥時間過短有很大的關系。

二、前十天的雛雞在使用聚醚類藥物時，如果瞬時、大劑量使用大環內酯類藥物時會出現癱雞的現象，嚴重時會導致大批量的死亡，在配伍上要引起足夠的重視。

3、治療。總的方針為殺蟲、止血、修復腸黏膜、防止球蟲腹瀉以及聯合用藥，防止耐藥蟲株的出現。