肉雞球蟲病危害較大，從感染到發病有一定的過程。當出現癥狀時，可能已經感染了大量的雞。因此，防治肉雞球蟲病的關鍵措施在于預防。

1、加強飼養管理 ： 飼料和飲水要保持清潔衛生。雛雞飼料的營養要全面，特別要保證蛋白質和維生素的要求，糞便、污物等要及時清除，防止糞便、污物對飲水、飼料、場地環境的污染，水槽、小碗或飲水器要堅持每天用消毒液或高錳酸鉀液擦洗一次。每天清糞一次、消毒一次，地面用3%的火堿水噴灑一次。

2、注意通風換氣 ： 肉雞無論籠養、地養、網養通風換氣尤為重要，特別是冬季暴發球蟲病往往是大部分農戶只注重保暖。要解決通風和保暖這對矛盾，首先要建造好育雛舍的火炕、鋪設好地表煙道，育雛舍根據外界溫度決定用爐子多少，要架設排煙管，把煙塵和有害氣體排出舍外。無論育雛或是育成，要求舍內溫度比其它季節高1-2度，利用好雞舍天窗，及時排出氨氣和硫化氫氣體。并在中午打開朝陽面窗的上角，自上而下，根據舍內溫度高低確定開窗面積，保持舍內干燥，以減少球蟲病的發生。