由于目前對本病的病原尚未最后確定，因此在診斷上只能根據臨床觀察到的生長發育遲緩，結合病理解剖學上的變化來作出初步診斷，如發病年齡，腹瀉、羽毛毛蓬亂、體形矮小、跛行以及腿骨的變化等。進一步確診需要進行病原分離和電鏡觀察，在有條件的實驗室可采取小腸、胰臟、腺胃等進行組織切片觀察。也可測定血漿中堿性磷酸酶的活性和類胡蘿卜素的濃度作為輔助診斷方法。

確診時也應與其他類似疾病如飼料、營養消化不良等相區別。