家禽營養代謝性疾病大多表現為缺素癥，有時也可因營養過剩引起。導致營養代謝性疾病的主要原因有如下幾種：

營養攝入不足飼料配比不合理，維生素、微量元素或蛋白質含量不足；長時間投料不足，家禽采食不到需要的營養元素；各種應激條件下，如：發生疾病，接種疫苗，驚嚇過度，氣溫異常，濕度過高，在這些情況下，家禽食欲下降，采食量明顯減少，若時間過長，就會發生營養代謝性疾病。

營養消耗過多家禽在生長旺盛期和生殖高峰期，蛋白質和鈣的需要量明顯增加，若不及時增加飼料配方中蛋白質和鈣的含量，就會導致相應的營養缺乏癥；家禽在發生熱性疾病、寄生蟲病、腫瘤性疾病、慢性傳染病時，營養消耗也會大量增加，也會引發營養代謝性疾病。

消化吸收不良家禽在發生消化道疾病如嗉囊阻塞、壞死性腸炎、病毒性肝炎時，不但營養消耗增加，而且消化、吸收、代謝都出現障礙，如果不能及時得到糾正，更容易發生營養代謝性疾病。

物質代謝失調家禽體內營養物質間的關系十分復雜，除了各營養物質獨特的特殊作用外，還可以通過轉化，協同，拮抗等作用，相互調節，維持平衡，如：鈣、磷、鎂的吸收，必須有維生素D參與，缺少了維生素D，即使飼料中不缺乏鈣、磷、鎂，機體內也會因難以吸收、轉化而造成無機鹽缺乏。

飼養方式改變與傳統的飼養方式相比，籠養雞不能從雞糞中獲得維生素K，若不注意調節補充，籠養雞易出現維生素K缺乏；為了控制家禽的球蟲病，有些養禽戶在飼料中長期添加抗球蟲藥物，這必然會影響腸道中的正常菌群，使合成某些維生素和氨基酸的常在菌受到抑制或被殺死，導致相應的營養代謝病。

營養搭配不合理長期飼喂高能量飼料，能量攝入過多，導致脂肪在肝臟內沉積過多，會引起產蛋禽脂肪肝綜合征；青年家禽脂肪沉積過多，會引起脂肪肝腎綜合征。