雛雞肝腎綜合癥的判斷主要跟軍癥狀來判斷。

病雞群大部分精神正常，個別雞出現閉眼呆立、羽毛粗亂、腹部脹滿、腹部皮膚發紺，有時發現有白色或黃綠色糞便，沒有呼吸道癥狀，從出現癥狀到死亡不到一天。剖檢可見皮下有少量黃色膠凍狀積液，胸肌呈熟肉狀或拈黃色，胸腺充血或萎縮，肺實質有充血絲；脾臟腫大、充血，為櫻桃紅色或為黑紅色；肝腫大紅黃色相雜，肝被膜上布有針尖狀銅綠色斑點，膽囊脹滿，膽汁外溢；整個腸漿膜為土黃色；腎為黃紅色或土黃色，輸尿管內有少量尿酸鹽；腿骨髓為灰白色。7日齡內雛雞卵黃囊變為黃綠色液體。