空氣通過鼻腔、喉頭直達肺與氣囊。肺呈海綿狀、鮮紅色、緊貼住胸腔側面，肺部三級細支氣管黏膜下布滿血管，所以肺是進行氣體交換的主要場所。氣囊是禽類特有的器官，其主要作用如同風箱，將空氣吸入推出，使之在肺部進行交換。氣囊同骨骼及其他臟器相互聯通，以減輕自身重量，這種解剖構造是禽類祖先適應飛行的進化結果。而恰恰是這一特點使得禽類在外界病原體通過呼吸道進入機體后，會很快發生全身感染。