嚴格用藥劑量，防止藥物中毒：由于某些市售抗球蟲藥的實際劑量不足以及抗藥性的存在，使一些養雞戶在使用抗球蟲藥時往往因達不到預期效果而盲目加大劑量，再加上飼料加工過程中可能出現的抗球蟲藥混合不均勻，在生產中就容易出現藥物中毒的現象。

搞好衛生工作，提高藥物的防治效果：做好雞舍和環境的衛生和消毒工作，保證雞舍通風良好，地面保持干燥，糞便及時清掃，雞糞和墊料做堆積發酵處理。這些日常工作雖然是老生常談，但卻是預防球蟲病，提高藥物防治效果最重要的。

掌握藥物作用的峰期，適時應用藥物：抗球蟲藥的作用峰期是指抗球蟲藥對球蟲作用最強的作用時間。由于不同的抗球蟲藥作用球蟲生長的階段不同，所以其作用峰期也不同。一般情況，作用峰期為感染后1～2天的抗球蟲藥作用弱，主要用于預防給藥，如克球粉、莫能霉素、氯羥吡啶等藥物；作用峰期為感染后第四天的藥物，一般抗球蟲作用較強，在臨床上主要作為治療應用，如尼卡巴嗪、呋喃類等藥物。