肉雞后期最常見的就是病毒病和腸道病，但很多時候診斷的時候有所偏差，約有一大半的人認為后期就是防病毒，把后期的一切癥狀（比如拉稀、減料、死亡等）歸為病毒的原因。

這些癥狀確實有可能是病毒造成，甚至很多時候可以說病毒脫不了干系，但也不能全歸為病毒所致，病毒只是一個導火線而已。雞群之所以拉稀、減料、死亡的直接原因也就是因為自身的抵抗力的下降，營養成分的匱乏或不平衡，使吸收和轉化器管的功能缺失，導致外界病原的感染（或感染后的體內細菌的滋生致病）。

當飼養環境中存在病原的時候,  機體自身如果正處于免疫力低弱期就會給病毒一個趁虛而入的機會，這時候就形成感染。但是感染并不代表發病，因為機體還有一定的抵抗能力能和外來病原抗衡，一旦抵抗力小于外來病原感染力，這時候才會發病。由于沒有抵抗力體質虛弱，故病毒細菌均可侵入致病！

當病毒和細菌同時感染時，群體就會表現快速發病混合感染，這時候做治療就需要雙管齊下。若病毒在先，則先表現為降料、綠糞、精神沉郁等偏向于病毒方面的癥狀，之后可見繼發癥狀：心包炎、肝周炎、氣管阻塞等，此階段前期可以只治病毒提高機體抵抗力，到后期還得全方位治療。另一種情況基本看不出病毒性癥狀，但大多時候都有死亡，解剖也僅表現腸道有些許病變，群體一般表現采食量降低，這樣的雞群病初體質并不虛弱，對癥治療即可，稍有發展（治療不及時）則會和病毒混感，該癥狀肉雞后期經常發生，都是治病毒沒治好，反倒對癥治療收尾，有一定的死淘率。

治療建議，加強飼養管理，不要忽視腸道病的治療，后期有超過半數的死亡和生長緩慢都是因為腸道不好，除此之外要注重凈化環境，即注意消毒，消毒要選高濃度高效產品，如復合碘。

藥品選擇依次為：病毒藥（雙黃連、禽感康、利克舒，當然，也可使用拌料的的雞場也可選用欣感靈和扶正解毒散）、腸道藥。如果群體狀態不良，要注意解表成分藥物的使用。