各種年齡的豬都可發生腹瀉，但是主要發生在這3個年齡群：出生后1日齡-3日齡仔豬，7日齡-14日齡仔豬和斷奶后的仔豬。新生仔豬腹瀉的發病率在日益增加，尤其是集中產仔管理的豬場。雖然仔豬腹瀉的病原是比較多的，而且是比較復雜的，但是最容易感染的病原就是針對某種病原的母源抗體消退，又同時感染的這種病原。當有大量的病原感染超過初乳或乳中抗體免疫控制力時腹瀉就會發生。產仔室的溫度、濕度、通風和衛生狀況等這些環境因素對仔豬腹瀉的嚴重程度和成活率及預防有重大影響。

就病原來說，最容易感染的病原就是大腸桿菌、傳染性胃腸炎、輪狀病毒和豬球蟲等。

大腸桿菌病如果認為大腸桿菌是腹瀉的主要原因，從母豬考慮，在母豬產仔前2周和產仔后2周內，給母豬服用阿莫西林—利諾結合劑;從仔豬考慮，做賽福的3針保健，對控制大腸桿菌病已證明是有幫助的。

傳染性胃腸炎、輪狀病毒仔豬發病率和死亡率的變化很大，這要取決于各母豬從奶汁中提供的乳內免疫力的數量和仔豬感染的年齡，發病率可達50%-100%，死亡率可在10%-30%，這要取決于豬群免疫力水平和環境因素。在新生仔豬的最初幾周內，幾乎所有的仔豬都可被輪狀病毒感染，但大多數病例都呈亞臨床癥狀。當持續不斷的產仔房內的病毒超過了仔豬的被動免疫保護力時，就會出現感染的臨床癥狀。對治療地方流行性傳染性胃腸炎或輪狀病毒的關鍵，是防止和控制大腸桿菌繼發感染。應當經低乳頭飲水器或緩流水飲水槽供給仔豬新鮮的口服電解質溶液、納米維生素(維多利)，并添加中成藥和抗菌物藥物(如止痢散和利諾)，可減少細菌繼發感染。母豬產前做好傳染性胃腸炎和輪狀病毒疫苗免疫工作。

球蟲病6日齡-10日齡的仔豬，被診斷為球蟲病的日益增多。較大規模的集約化養豬生產，可能增加了球蟲病的流行。控制球蟲病的中心應圍繞懷孕與產仔設施的衛生和產仔前對母豬的治療，基本的前提是防止新生仔豬吃入蟲卵。為了減少母豬產生蟲卵，預防幼豬可能感染，在母豬產仔前2周和產仔后2周內，在飼料中添加球蟲藥物。在產仔前4周～6周給母豬服用金霉素—磺胺甲基嘧啶結合劑，對控制球蟲病有一定幫助。