綜合利用的目的是使養豬場的糞污得到資源化利用。畜禽糞便同工業污染源生產的廢棄物不同，畜禽糞便是一種有價值的資源，它包含農作物所必需的氮、磷、鉀等多種營養成分。還含有75%的揮發性有機物，經處理后可作為肥料、飼料、燃料，具有很大的經濟價值。

污水經過適當的凈化處理可以用于農田、綠地的灌溉，進入漁塘養魚，有條件時還可考慮回用沖洗畜舍。固體糞污經處理后可作為高效有機肥。利用畜禽糞便生產有機肥，不僅可減輕畜禽糞便對環境的污染，還可提高土壤有機質含量，提高土壤肥力。因此規模化畜禽養殖業的污染防治必須首先建立在資源化利用的基礎上。

畜禽養殖場糞污處理和綜合利用技術除固體糞便的堆肥化處理之外，還包括固體糞便培養蚯蚓和養殖藻類、液體污水沼氣綜合利用等。

1、蚯蚓生物反應器技術

蚯蚓生物反應器技術是一種利用蚯蚓和微生物相互作用高效處理有機廢棄物并同時生產有機肥料的新技術。該生物反應器工藝簡單，造價較低，易于在中國推廣。蚯蚓生物反應器目前在英美投入使用的較多，且全過程運行自動化，主要參數電腦控制，處理效率較高。目前已有10多個國家引進推廣。中國農業大學資源環境學院孫振均教授通過與英美學者合作研究，對該技術進行了進一步得改進，使之成本更低，更能符合中國的實際情況。該項技術在中國已進行了部分研究和試點。

2、固體糞便養殖藻類

藻類能將畜禽糞便中的氨轉化為蛋白質，而藻類可用作飼料。目前該項技術也在研制和試點階段。試驗結果表明，用1噸新鮮豬糞堆漚產氣，可制取足夠的二氧化碳來供應5000-10000L的螺旋藻培養池。

3、液體污水沼氣綜合利用技術

中國在沼氣發酵和沼氣綜合利用方面有較為長期的經驗，該項技術得到了廣泛應用。沼氣綜合利用是指畜禽糞便經沼氣池發酵后，所產生的沼氣被作為清潔能源利用，而沼液、沼渣按食物鏈關系作為下一級生產活動的原料、肥料、飼料和添加劑等進行再利用。

沼液是含有多種養分的速效肥料。長期施用沼液肥可改善土壤理化性狀，使土壤有機質、全氮、全磷及有效磷等養分均有不同程度的提高。沼液可用于浸種、葉面噴施肥和無土栽培營養液。

沼液養魚也是得到廣泛應用的技術。水產養殖業大多向漁塘中投放化肥，往往導致魚類患氣泡病和缺氧死亡的不良后果。以沼液替代化肥投入漁塘，可培肥水質，有利于魚類的生長和發育，生產出味道鮮美、無污染、無公害的水產品，經濟效益較高。

沼渣大多作為優質有機肥使用。沼渣含有較全面的養分和豐富的有機物，其中有機質在36%-50%，粗蛋白5%-9%，全氮0.8%-1.5%，全磷0.4%-0.6%，全鉀0.6%-1.2%，還有一些富含礦物質的灰分，是優質的有機肥料。用沼渣栽培蘑菇，質量好，雜菌少，產量較傳統培養料增產10%以上。