雞舍常用消毒藥品的選擇與其他藥物一樣，化學消毒藥對微生物有一定選擇性，即使是廣譜消毒藥也存在這方面問題。

不同種類的微生物（如細菌、病毒、真菌、霉形體等），或同類微生物中的不同菌株（毒株），或同種微生物的不同生物狀態（如芽胞體和繁殖體等），對同種消毒藥的敏感性并不完全相同。所以，在選擇消毒藥時應根據消毒對象和具體情況而定。

首先要考慮該藥對病原微生物的殺滅效力，其次是對雞和人的安全性，同時還應具有來源廣泛、價格低廉和使用方便等優點，才能選擇使用。