畜禽遺傳資源的保存是根據保種規劃，對現有的資源進行調查,同時要挖掘新的遺傳資源，作出種質鑒定和評價其利用前景，有計劃地對畜禽遺傳資源實施保存和利用。畜禽遺傳資源保護及其利用問題，是一個在國際、國內上的老話題，但在當今世界經濟一體化的新形勢下又賦予其新的認識。

我國畜禽遺傳資源豐富，特別是地方品種的優異種質特性，是幾千年來多樣化的自然生態環境所選擇的結果，也是勞動人民長期選育的結果，許多優良地方畜禽品種具有適應性強、耐粗飼、繁殖率高和產品優質的特點，有的品種產肉性能好，有的產奶性能好，有的產毛、產絨性能好，有的產蛋性能好，有的役用性能好，有的具有高繁殖力特性……但近年來，隨著我國生態環境和生產狀況的不斷變化，我國地方保種形勢不容樂觀，據2000年調查17個省區的331個品種中，處于瀕危與將要滅絕的品種有59個，占調查總數的18%。另有7個品種已經滅絕，例如大普吉豬、蕭山雞、文山鵝、思茅鵝、草海鵝等。大量品種處于瀕危或滅絕狀態的主要原因，一是盲目引入國外的高產品種，二是“雜交”的繼續濫用。我國畜牧業尤其是豬、禽、肉牛、肉羊的飼養業，一味單純引入國外所謂的高產品種，雖然可以暫時在國內取得一些短期的經濟效益。但從長遠發展觀點來看,我國的畜牧業只能發展成世界發達國家畜牧業的附庸。而盲目濫用雜交，必將喪失我國數千年形成的畜禽遺傳基礎的優勢，徹底破壞和摧毀我國獨特的地方畜禽品種若干優異特性與潛在的產品優勢，使我國畜產品在國際競爭中失去可發掘的相對優勢，失去我國畜產品在未來國際市場上的地位。如不加強資源保護，將會繼續給我國畜禽遺傳資源帶來嚴重的后果。

在世界經濟一體化不斷深化的今天，世界各國都在積極尋找適合本國的畜牧業經濟發展模式。在這一歷史背景下，我國畜牧業與地方品種既面臨挑戰,同時也是開創新局面的機遇。這一新機遇也可能給中國畜牧業走向世界開創新的出路。國內外多年來對保種工作的實踐經驗表明，要正確處理引入高產品種與本國地方品種的關系。通過保種的各種手段，保護畜禽遺傳資源與遺傳基礎的多樣性，開發與利用我國地方品種特有的性能，將保種與開發相結合，走開發性保種和主動保種的道路，既起到保種的作用,又可開發獨具特色的中國畜禽產品,利用此類畜產品在國際畜產品市場上的相對優勢，推動我國畜牧業的發展。

因此，要切實貫徹《畜牧法》，落實畜禽地方遺傳資源保護的各項措施,加強各級政府主管部門在地方遺傳資源保護方面的主導作用，增加工作經費和適當經濟補貼，引導社會力量參與，逐漸形成市場經濟運作方式。根據《種畜禽管理條例》和《種畜禽管理條例實施細則》強制淘汰劣質種畜禽，提高種畜禽品質，以促進我國畜牧業可持續發展。