7月27日以來，吉林市遭遇特大洪水災害，給畜牧業造成嚴重損失。全市1.07萬個養殖場（戶）受災，圈舍倒塌損毀47.7萬平米。因災損失畜禽121.7萬頭（只），直接經濟損失將近2.9億元。為確保大災之后無大疫，全面加強災后疫病防控和做好大量因災死亡畜禽無害化處理工作，吉林市畜牧局快速反應，及時部署，于8月5日，提前15天開展秋季動物集中防疫。

一是加強消殺滅源工作。從8月初到年底至少對養殖場戶實施地毯式全面消毒3次；要求過水受災養殖場戶必須要等到徹底消毒后，圈舍干燥，飼料保障安全后，才能進行補欄再養。二是加強畜禽預防免疫工作。繼續做好秋季畜禽的高致病性禽流感、牲畜口蹄疫、高致病性豬藍耳病、豬瘟等強制免疫的同時，要有針對性開展炭疽、丹毒、肺疫、鏈球菌和球蟲病等災后易發動物疫病的防治。三是加強動物疫情監測工作。要求各縣（市）區要組織鄉村防疫人員加強疫病巡查和監測，加大監測范圍和頻次，及時發現和消除疫情隱患，嚴密掌控動物疫病發生態勢，發現問題要及時上報、科學果斷處理。四是加強動物檢疫和衛生監督執法工作。繼續對加強對養殖源頭的產地檢疫和防疫監管，加強對逃避檢疫、拒絕免疫、不配合疫情監測等違法行為的監督執法力度。加大對災區畜禽飼養、運輸、屠宰和畜禽產品加工儲藏等生產和經營環節的監督管理力度，嚴厲打擊販賣、轉運死亡畜禽及其產品的違法行為，對因災死亡或死因不明畜禽要嚴格執行“四不準一處理”的要求，加大對農貿市場、冷庫等經營、貯藏場所的監督檢查力度，嚴禁病死畜禽流入市場。在全面完成秋防動物防疫工作的同時，要積極做好重大動物疫病防控工作，確保全市災后及全年不發生重大動物疫情。

截止到目前，全市共派出1640多名專業防疫人員，對過水養殖場集中區域和養殖場戶對畜禽圈舍及周邊環境進行地毯式全面消殺滅源，累計使用消毒藥品91噸，生石灰640余噸，共消毒養殖場7.6萬戶，消毒面積達3.2萬平方米。全市共無害化處理死亡畜禽共計67.2萬頭（只）。全市累計免疫注射牛13.8萬頭、豬23.2萬頭、禽38.7萬只，完成秋防免疫任務的15%。