近年來，我國在重大動物疫病防控方面實施了以“三補一建”為主的扶持政策。“三補”指重大動物疫病強制免疫補助、強制撲殺補貼和基層動物防疫工作補助；“一建”指動物防疫體系建設。這些政策惠及廣大養殖場戶，對提升我國動物疫病防控能力和水平發揮了重要作用。

自2001年起，我國實行對牲畜口蹄疫進行強制免疫，2005年開始對禽流感進行強制免疫，2007年開始對高致病性豬藍耳病、豬瘟和小反芻獸疫進行強制免疫。“十一五”期間，中央財政投入各類強制免疫疫苗經費近120億元，重大動物強制免疫補助政策使全國禽流感等重大動物疫情逐年下降，疫情起數明顯減少，疫情范圍明顯縮小。

目前，我國對高致病性禽流感、口蹄疫、高致病性豬藍耳病、小反芻獸疫發病畜禽和布病、結核病檢測陽性奶牛實施重大動物疫病強制撲殺經費補貼。近年來，中央財政投入強制撲殺補助經費近4.5億元，通過這項政策，減少了養殖戶的損失，調動了養殖戶防疫積極性。

同時，近年來，中央財政對基層動物防疫工作給予穩定的經費補助，提高村級防疫員待遇。2008~2010年，中央財政每年安排基層動物防疫工作補助經費6.5億元。今年7月，中央財政又將基層動物防疫工作補助標準提高到1200元/人/年。

此外，動物防疫體系的建設對改善防疫基礎設施、擴內需、促增長發揮了積極作用。“十一五”期間，國家組織實施了《全國動物防疫體系建設規劃》，全國動物防疫體系建設累計投入資金83.8億元，初步形成了覆蓋全國的中央、省、縣、鄉四級防疫網絡，建立健全了動物疫病監測預警、預防控制、檢疫監督、獸藥監察，防疫技術支撐和物資保障等系統，形成了上下貫通、橫向協調、有效運轉、保障有力的動物防疫體系，提高了重大動物疫病預防、控制和撲滅能力，獸藥質量監察和獸藥殘留監控能力，動物及動物產品質量安全追溯能力。