9月17－18日普降暴雨，全市降雨量達300mm-400mm的站點14個，雨量超過400mm的站點4個，最大降雨量達459.5mm，導致巴中遭遇一百六十年來的特大洪災，巴州區惠昌養殖場成為此次洪災重災區，19日市畜牧食品局組織生產科教、動物衛生監督、動物疫控中心等單位負責人，組成抗災自救指導小組，率領區畜牧食品局相關科室人員趕赴巴州區曾口鎮惠昌養殖場受災一線，市（區）兩級畜牧局業務骨干經現場查看、集體會商，迅速確定抗災自救方案，并將搶救方案送達曾口鎮黨委政府，請求地方政給予人力機械支持，及時開展抗災自救。

一是現場清理。迅速落實區畜牧食品局站所職工30余人，協助養殖場職工清理洪災后存活豬只40余頭，積極聯系周邊場地，轉移存活豬只，嚴格隔離飼養觀察。二是核查災情。經初步調查核實，惠昌養殖場死亡豬只1800余頭（其中種公豬15頭、種母豬355頭、育肥豬1500頭），損毀圈舍20000余平方米，沖毀飼料100余噸，直接經濟損失達2000余萬元；三是無害化處理。計劃自20日開始組織10人，調用裝載機、運輸車輛各一臺，迅速收集養殖場內災后死亡豬只，組織沿河村民打撈漂浮死亡畜禽，全鎮集中設置無害公處置點，指定專業技術人員指導無害化處理工作。四是消毒滅源。市畜牧局于19日下午緊急下撥清毒劑4噸、機動噴霧器8臺,計劃在9月21日開始，由當地政府組織人力50人，開展清淤打掃工作，自22日開始全面消毒滅源工作，盡早恢復生產。五是緊急免疫。結合動物秋防工作，集中優勢技術人員30余人，在重災區域及周邊環境開展緊急免疫接種工作，確保災后清凈無疫；六是責任到人。為及時有效地開開展幫扶自救工作，穩定業主情緒，盡快恢復生產，市畜牧局確定了一名局領導班子成員負責全面指揮協調，市動物疫病控制中心確定一名技術人員負責現場技術指導，領導及技術人員負責現場值守，坐陣指揮，跟班作業。