第一、疫病防控問題，疾病問題成為目前蛋雞養殖業得最大的阻礙，可以說雞病的影響，在最近幾年是越來越厲害，如何解決這個問題，至少要從三個方面著手，首先是政策層面，國度的防疫系統和防疫觀念的改變，比不可少，包括疫情通報、活禽運輸、防疫掌握等等.

第二、蛋品質量安全和終端銷售問題，目前的雞蛋絕大部門都以未經處理的鮮蛋在農貿市場進行銷售，隨著消費者對食品安全問題的重視，雞蛋的商品化和品牌化必將到來，沒有誕生證的雞蛋不合乎食品安全控制的需要，也很難保障食品安全和品質問題。所以，不管規模大小，未來的雞蛋作為商品，一定要做到可以追溯的質量治理體制，這一點，小型的規模場很難做到.

第三、產品深加工問題，目前雞蛋的加工方興未艾，潔蛋處理，液氮、蛋粉加工等各種雞蛋的加工名目紛紜上馬，雞蛋的加工看似繁榮，卻疏忽我國消費者得消費習慣的問題，如何改變消費者長期以來以鮮蛋為主的消費習慣，可以說是任重而道遠。對于中小型的養殖場來說，雞蛋加工基本和他們不沾邊，要走產品加工的路線，傳統食品、特點蛋品等開發和加工是一條出路；小型養殖戶聯合起來，進行結合銷售是另外一條前途。目前，養殖協作社在各地風起云涌，但至少從目前看來，配合社要想在蛋品加工方面有所成績，還不具備條件.