1、雞苗的帶菌帶毒現象時有發生。在西方發達國家，種雞場對沙門氏菌和大腸桿菌的血清學檢測，每月都要進行，一旦發現陽性感染即全群淘汰，以確保商品代雞的健康。而在我國能夠這樣做的雞場幾乎沒有，關鍵是成本太高淘汰不起，有點病只要能夠治療的花些錢無所謂，因為總體來說，種雞的贏利空間還是比較大，但是，這卻給商品雞的帶來飼養難度增加、用藥成本居高不下等一系列隱患。

2、在市場低迷的時候，種雞場為降低苗雞的成本，盡量減少種雞的防疫次數，腦脊髓炎等某些該防的病不防了，該用油苗免疫的也改為成本較低防疫效果較差的凍干苗，而這樣一來，事必造成苗雞對某些疫病的免疫力下降，養雞的風險也就增加了許多。

3、環境的不間斷污染。有這樣一種現象，養雞戶在一個新地方剛開始起步時，不用怎樣消毒，有的甚至不防疫也沒有大問題，等到一年以后，尤其是養殖小區，無論是怎樣防疫和怎樣消毒，總是疫病不斷。歸根結底，是養殖環境的污染，盡管采取加強消毒、注射油苗等綜合防治措施，但仍不能從根本上解決問題。尤其感染法氏囊炎和腎傳支的雞場，甚至雞場閑置半年以上，等到再進雞的時候仍然能夠感染法氏囊炎病毒。由此可見病毒在雞場中的存活時間。

4、缺乏成功的養殖經驗。不少養殖戶看起來規模很大，動者上萬只的飼養，養殖的時間也不下十余年，但讓他談起經驗卻沒有，不知道怎樣成功或怎樣失敗的，只是稀里糊涂的養，賠錢賺錢都有，往往一年平均下來，賺三批陪兩批，相當于一年只養了一批雞，原來犯過的錯誤現在照樣還犯，原來感染的雞病照樣感染，到頭來只是認為自己倒霉，或者別人賠錢自己賠錢也不算額外，下一批雞一定能賺回來。

5、藥物的不規范使用。部分養殖戶不注重飼養管理水平的提高和飼養環境的改善，只是一味的用藥，從進雞到出欄停藥的天數寥寥無幾，有病治病沒病預防，細菌病用藥病毒病仍然用藥，一天不用藥心里就感到不踏實，這樣一來增加成本的同時，使雞體的藥殘大大增加，無疑給人類的食品安全帶來隱患，同時也增加了細菌的抗藥性，無論對雞群還是對人類的疾病治療都產生極大的影響。這一點固然和部分養殖戶的認識水平和狹隘的思想意識有關，但是個別獸醫見利忘義的道德觀念和部分獸藥廠家對治療范圍、療效夸大其詞的宣傳不能不引起我們的重視。

6、缺乏正確的養殖態度。這里并不是說拿養殖當兒戲，因為大部分養殖戶養雞都是傾其所有，甚至借錢貸款，他們有時只是想賭一把，盤算自己現在上雞等到賣的時候應該價格不錯，不去從管理上下工夫，到頭來賠了錢只是埋怨市場。其實，現在的養殖業已經進入到微利時代，養殖量的普及使原來每只雞3元多的利潤已不復存在，賺錢靠的是管理，靠的是規模，兩者都沒有只憑算計市場，不少戶是每到賣雞的時候價格就下跌，賣完雞價格就上揚，結果往往是批批賠錢，極大的挫傷了養殖戶的積極性。