為提高動物疫病監測、動物衛生監督、獸藥監管的信息化管理水平，農業部大力推進獸醫系統信息化建設，目前已取得重要進展。

　　重大動物疫病防控信息管理系統發揮重要作用。農業部2008年建立了“重大動物疫病防控信息管理系統”，2010年對系統進行了全面升級。2012年，各地動物疫病預防控制機構通過該系統填報防控政策、防控應急管理、應急物資儲備、疫苗訂購與使用等事項，便于及時準確掌握疫苗、免疫情況進展和防疫物資等基本信息，為科學制定防控政策提供數據支持。該系統在春、秋兩季重大動物疫病防控工作中，尤其在“加強重大動物疫病防控”延伸績效管理的評估工作中發揮了重要作用。

　　動物衛生監督信息化建設深入開展。2012年，農業部印發《農業部關于推廣河南省動物衛生監督執法能力建設經驗的通知》（農醫發[2012]27號），以河南省實施動物檢疫合格證明電子出證為案例，推廣動物衛生監督信息化經驗做法。北京市研發的“北京動物衛生監督網”開設“服務大廳”專欄，公開“進京入滬供津”、“跨省調運”、“托運寵物”等業務辦理流程，方便公眾查詢辦理。重慶市建設完成《重慶市動物衛生監督指揮調度平臺》（動監110），全面覆蓋各縣、鄉動物衛生監督所（分所）和各動物衛生監督檢查站，實現了各監督所和檢查站實時聯網調度。遼寧、吉林、河北、青海、廣西等省（自治區）已完成電子出證系統研發工作，開始在各地推廣應用，逐步實現動物檢疫合格證明電子出證、網絡查詢、快速溯源，有效提升動物衛生監督信息化監管水平。

　　獸藥監管信息化建設取得突破。2012年，獸醫局組織中國獸醫藥品監察所建設完成國家獸藥基礎信息查詢系統I期，并于2012年8月20日上線試運行。通過查詢系統，可快速查詢獸藥生產企業GMP證書、獸藥生產許可證、獸藥產品批準文號、生物制品和進口生物制品批簽發等審批情況以及獸藥監督抽檢檢驗情況，查詢系統中的數據相互關聯、信息完整，極大地滿足了全國獸藥監督執法以及社會公眾查詢需要，促進了行業誠信自律。此外，天津、內蒙古和廣東等地在獸藥經營信息化監管建設方面取得了積極進展，有力促進了獸藥監管工作開展。