由丹麥食品、農業和漁業部授權進行的一項研究表明，有機豬養殖模式下的仔豬死亡率很高。科學家們正在努力研究提高其存活率。丹麥食品、農業和漁業部及豬場聯盟在2011年達成了一項行動方案，旨在降低仔豬死亡率，還將重點關注一項長期的育種項目來確保更多的仔豬存活下來。這一方案會給傳統生豬養殖及有機生豬養殖帶來益處。近期一份由丹麥奧胡斯大學發布的研究表明，對比傳統生豬養殖，有機豬養殖中仔豬死亡率較高的原因有以下幾點。飼養者在傳統生豬養殖模式下使用的一些管理方法，并不能夠在有機豬養殖中使用。比如，在傳統豬養殖模式下，可以把大量仔豬轉給自產仔豬已經斷奶的母豬喂養，但有機豬養殖卻不可以。另外，在有機豬養殖中，母豬是在開放的豬欄中產仔，這就難以控制產期和早期哺乳期，如果此時出現問題，那么將難以控制。最后，有機豬更容易受到自然災害的襲擊，例如來自狐貍和猛禽等的攻擊。來自有機豬豬場的研究表明，其仔豬死亡率為33%，這比傳統生豬養殖中的仔豬死亡率要高。降低有機豬養殖中仔豬死亡率這個需求很迫切。科學家們指出需要在有機豬的產仔區設計上做出革新，改進監控工具和母豬通道，方便更好地調整每窩產仔數和管理哺乳母豬。有機母豬需要產下相對較少但更大更強健的仔豬，這樣母豬就可以更好地照顧自產仔豬。