加強畜牧業重大戰略問題研究，是謀劃現代畜牧業發展路徑的重要措施。2013年，畜牧業司緊緊圍繞現代畜牧業發展的關鍵環節，依托農業部農村經濟研究中心、中國農科院農業環境與可持續發展研究所、農業經濟與發展研究所和產業技術體系等單位和專家，組織開展了現代畜牧業評價指標體系、畜禽良種繁育體系扶持政策實施效果評價和畜禽養殖廢棄物處理模式應用效果評價等課題研究。
目前，3個課題都已取得階段性成果?，F代畜牧業評價指標體系課題在深入研究現代畜牧業的內涵和特征的基礎上，提出了支持保護水平、物質裝備水平、科技發展水平、經營管理水平和安全可持續水平5個一級指標和規模養殖比重等17個二級指標。畜禽良種繁育體系扶持政策實施效果評價課題通過對現有扶持政策實施情況和實際效果的分析評價，有針對性的提出了優化投資結構、提升政策實施效果的意見建議。畜禽養殖廢棄物處理模式應用效果評價課題結合我國畜牧業發展現狀和畜禽糞污處理利用技術現狀和持續運行的可能性，立足不同區域提出了“三改兩分”再利用模式、沼渣沼液農業利用養分平衡技術模式、糞便集中處理中心模式等先進適用技術模式。
下一步，畜牧業司將組織開展對已完成戰略研究的論證，推進戰略研究成果的充分運用，同時根據畜牧業發展實際組織開展進一步的深入研究，為健全完善畜牧業支持保護體系提供強有力支撐。
