為提高動物衛生監管執法水平和動物防疫公共服務能力，促進畜牧業發展和農民增收，2006年以來，寧國市大力實施了較為全面、系統的獸醫體制改革，逐步建立起科學、統一、透明、高效的獸醫管理體制和運行機制，建立健全動物疫病防控的長效機制，穩定強化動物防疫體系，提高獸醫管理機構依法行政能力和水平，促進動物衛生工作全面開展。

    一是健全獸醫行政管理機構。
將“寧國市畜牧獸醫局”列為市農委二級副科級行政管理機構，其主要職責為貫徹執行動物衛生方面的法律法規、方針政策、規劃和計劃，研究制定本市行政區域內重大動物疫病防控計劃，指導、監督、撲滅疫情，管理本地區動物防疫、檢疫工作，負責獸醫醫政、藥政和官方獸醫及執業獸醫管理、獸醫實驗室生物安全管理等工作。

    二是健全獸醫行政執法機構。組建“寧國市動物衛生監督所”，其主要職責為依法實施動物防疫監督、動物及動物產品檢疫和獸藥飼料生產經營監管等牧業行政執法工作。

    三是健全獸醫技術支持體系、穩定畜牧技術推廣體系。按照“統籌規劃、整合資源、明確職責、合理布局”原則，整合現有畜牧、獸醫技術機構和資源，設置“寧國市動物疫病預防與控制中心”和“寧國市畜牧獸醫技術推廣中心”，實行“一套機構、兩塊牌子”。其主要職責為負責實施動物疫病監測、預警、預報、實驗室診斷，承擔動物流行病學調查、疫情報告編制并上報，提出重大動物疫病防控技術方案并組織實施，承擔動物疫病預防技術指導、技術培訓、科普宣傳，承擔動物產品安全相關技術檢測工作。同時，還承擔公益性技術推廣職能，負責畜牧業重大技術的試驗、示范和推廣，參與畜禽飼養、草業、品種改良等地方標準和技術規范的制訂并組織實施，提出畜牧業發展的重要技術措施，開展畜牧業職業技能鑒定。

    四是完善片鄉村三級防疫體系建設。按區域劃片設置六個畜牧獸醫站（動物衛生監督站），在各鄉鎮經濟技術服務中心設動物防疫員崗位，配備專業人員19人，每個行政村配村級防疫員117名，為農民身份，由鄉鎮聘用，每人每年補助2400元。畜牧獸醫站（動物衛生監督站）主要職責為負責宣傳貫徹畜牧業法律法規和相關政策，開展畜禽養殖技術推廣，實施區域內的動物及動物產品檢疫，負責區域內的獸藥、飼料、飼料添加劑、畜產品質量安全監督管理和動物疫情測報，協助區域內各鄉鎮的動物防疫、畜牧生產統計工作。動物防疫員主要職責為開展動物防疫法律法規的宣傳，組織轄區內動物防疫工作的實施和防疫檢查，負責轄區內動物疫情監測報告、村級動物防疫員的管理、畜牧生產統計工作。村級防疫員主要職責為實施動物免疫注射，發放免疫證明，填寫免疫登記表，對豬、牛、羊加掛耳標，負責動物疫情觀察報告，協助進行產地檢疫和病死畜禽無害化處理，承擔普查、消毒、撲滅重大動物疫情等工作任務。

    五是建立公共財政保障機制和動物防疫應急儲備制度。將獸醫行政管理、動物衛生監督、動物疫病預防控制和畜牧獸醫技術推廣機構所需經費納入財政全額預算管理，保證其人員經費和日常運轉費用。其依法收取的行政事業性收費一律上繳財政，實行“收支兩條線”管理。對經費使用情況要加強監督管理，確保專款專用。

    同時，建立起市鄉兩級應急防疫物資儲備庫，對應急設施、設備、疫苗、藥品、防護用品、交通、通訊工具等有關物資進行儲備，所需經費列入市級財政預算。市財政設立了應急防疫儲備金。