華南農業大學獸醫學院亓文寶教授課題組通過病毒分離鑒定、全基因測序，結果表明我國西南地區主要的禽流感病毒亞型為H5N6，H7N9和H9N2，其中H5N6為主要流行的亞型。
進一步對H5N6進行遺傳進化分析，發現除了一株H5N6處于2.3.2分支以外，其余都為2.3.4.4分支
Journal of Infection雜志發表了一項研究文章，華南農業大學廖明教授和亓文寶教授為文章的通訊作者。該研究揭示了我國西南地區H5N6亞型禽流感病毒的進化規律以及傳播路徑，對防控H5N6亞型禽流感病毒具有指導性意義。
自2014年首次報道人感染H5N6亞型流感病毒以來，H5N6不斷在我國以及東南亞國家的家禽中爆發流行，并持續出現感染人的病例。H5N6亞型禽流感病毒宿主分布較為廣泛，除了感染家禽之外，還感染野鳥，豬，貓，狗等宿主。此外，H5N6亞型禽流感病毒在全世界逐漸呈現擴散的趨勢，目前已經在中國、越南、老撾、韓國、日本、英國等地區相繼出現H5N6亞型禽流感病毒，并且其內部基因持續與低致病性禽流感病毒發生動態重配現象。
之前大量研究表明我國南方地區是H5N6亞型禽流感病毒的主要“聚集地”，也是南方地區禽流感病毒主要流行的亞型。但是，關于我國西南地區H5N6亞型禽流感病毒的研究卻很少，我國西南地區位于中亞和東亞-澳大利亞候鳥遷徙線，并且靠近南亞一些國家，并且2014-2016年相繼在我國的四川、云南、廣西等地區出現H5N6流感病毒感染人的病例，因此，對我國西南地區的H5N6亞型禽流感病毒的進化分析刻不容緩。
華南農業大學獸醫學院亓文寶教授課題組自2015年初至2017中旬在我國云南和廣西等地區的活禽交易市場、養殖場對雞、鴨、鴕鳥、鵪鶉等動物進行持續的流行病學調查，分離到128份陽性樣品。通過病毒分離鑒定、全基因測序，結果表明我國西南地區主要的禽流感病毒亞型為H5N6，H7N9和H9N2，其中H5N6為主要流行的亞型。
進一步對H5N6進行遺傳進化分析，發現除了一株H5N6處于2.3.2分支以外，其余都為2.3.4.4分支，有趣的是，H5N6病毒在感染人之前，環境中病毒的動力學較為復雜，內部基因出現了多種重配現象，其中包括PB2與H6亞型禽流感病毒發生重配，PB1與蒙古流行的H10亞型禽流感病毒發生重配以及與H3亞型豬流感病毒發生重配。
此外，通過對我過西南地區H5N6亞型流感病毒基因型分析，發現西南地區基因型呈現多樣性，其中包括G1, G2, G1.1, G1.2, G1.1.a, G1.a, G1.1.b等，其中在廣西地區鴕鳥身上分離到的G1.1.b基因型與廣西2016年底H5N6感染人的基因型相同，并且基因的同源性很高， H5N6亞型禽流感病毒能夠在當地進一步發生重配進而跨宿主傳播感染人。
隨后，研究人員進一步對我國西南地區的H5N6亞型禽流感病毒進行系統地理發生學分析，其中發現在西南地區分離的H5N6毒株與候鳥的遷徙距有相關性，2015年-2016年分離到的毒株內部基因與青海湖野鳥身上分離到的H5N6亞型禽流感病毒同源性極高，并且PB1與蒙古野鳥來源的H10毒株在同一遺傳進化分支。
此外，2017年分離到的毒株內部基因與韓國日本野鳥來源的H5N6毒株親緣關系很近，進一步表明我國西南地區對H5N6亞型禽流感病毒的進一步重配以及禽流感病毒通過候鳥的傳播起到很重要的作用，隨著H5N6亞型病毒的持續增加以及地理位置范圍的擴大，必須開展積極有效的防控措施，阻止病毒在家禽中的傳播范圍繼續擴大，從而降低對人的感染幾率。
