北京市畜牧總站聯(lián)合中國農業(yè)大學、北京六馬養(yǎng)豬科技有限公司、北京養(yǎng)豬育種中心和北京順鑫農業(yè)股份有限公司小店畜良種場等單位，積極實施北京市重大科技項目“基于基因組選擇平臺的種豬繁育體系建立與應用”。項目自2015年啟動以來，項目進展順利，取得了豐碩成果，引領著北京種豬產業(yè)向高代次高端發(fā)展，強化北京市“種業(yè)之都”的地位，推動種業(yè)之都建設，以品種輻射全國，擴大北京農科城科技創(chuàng)新對全國的輻射帶動作用。

一是豬基因組選擇平臺建設進展順利。優(yōu)化DNA提取、質檢、雜交和掃描等檢測程序，建立一套高效的高密度SNP芯片檢測技術體系；完成“全基因組SNP芯片檢測編輯程序”。完成逆回歸育種值計算方法比較、多性狀基因組育種值估計、全基因組關聯(lián)分析與基因組選擇整合策略、中低密度SNP芯片到測序數(shù)據(jù)填充策略等相關理論和方法研究，編寫“基于一步法策略的基因組育種值估計軟件”和“基于自動化需求的全基因組選擇數(shù)據(jù)準備軟件”；制定了基因組選擇參考群體構建標準，并按此標準采集完成2725頭個體的血樣，完成DNA的提取工作；并收集整理相關系譜和生產性能測定和繁殖成績；完成2445個樣本的高密度SNP芯片檢測工作。

二是專門化品系選育持續(xù)推進。引進加拿大種豬828頭。充分利用現(xiàn)有種豬資源和培育的專門化品系，組建15個專門化品系，核心群規(guī)模3651頭。采用開放與閉鎖相結合的選育模式，以大規(guī)模性能測定為基礎，結合常規(guī)和分子育種技術，采用BLUP模型，進行持續(xù)選育。各品系生產水平有了較大提高。

三是最優(yōu)雜交組合篩選進展順利。按照高繁殖力、大體型和節(jié)糧型的雜交組合篩選方案，開展13個二元雜交組合試驗，配種522窩，產仔449窩，F(xiàn)1代測定2096頭；開展7個三元雜交組合配種293窩，產仔240窩，F(xiàn)2測定585頭。

四是示范基地建設快速推進，種豬供種能力大幅提升。3個種豬企業(yè)在北京、河北、四川、海南、陜西、江蘇、安徽、山西、遼寧、山東、黑龍江、河南等12個省市區(qū)，建設示范基地39個，基礎母豬達3.08萬頭；祖代種豬供種能力由10萬頭增加到11.11萬頭，父母代種豬供種能力達13.73萬頭。

五是學術成果豐碩。發(fā)表論文10篇，申報專利1項，獲得軟件著作權1項。